Работа пользователя в системе "1С:Предприятие" заключается во вводе и обработке информации с использованием процессов, определённых в прикладном решении (конфигурации).

После запуска приложения открывается основное окно, в котором пользователь получает доступ ко всем разделам и функциям прикладного решения. Главное меню может быть расположено горизонтально (в верхней части окна) или вертикально (слева).

Переход между разделами осуществляется с помощью команд главного меню. Внутри разделов навигация и вызов нужных функций выполняются через элементы интерфейса формы: панель навигации формы, команды действий и контекстные меню. Отображение этих элементов зависит от настроек конфигурации.

В начале работы обычно требуется ввести значения констант и заполнить справочники. Справочники также можно заполнять в процессе учёта.

Учёт хозяйственных операций осуществляется с помощью документов. Для просмотра операций используются списки и журналы документов. Информация, зафиксированная в документах, хранится в регистрах.

Для анализа данных и выполнения расчётов применяются отчёты и обработки. Через них можно получать сводную и детализированную информацию, обмениваться данными с другими системами и выполнять вспомогательные действия.

Конфигурация может использовать различные механизмы учёта. Для управленческого учёта применяются планы видов характеристик и регистры накопления. Для бухгалтерского учёта — планы видов характеристик, планы счетов и регистры бухгалтерии. Для расчётных задач (например, расчёта заработной платы) — планы видов расчёта и регистры расчёта.

Для выполнения вспомогательных операций можно использовать сервисные режимы.

Система "1С:Предприятие" также позволяет создавать текстовые, табличные и HTML-документы с помощью встроенных специализированных редакторов.

Создание и ведение списка пользователей, назначение прав доступа, настройка журнала регистрации, выгрузка и загрузка информационной базы выполняются администратором.